■

　しっかりデータを積み重ねてから書きたい気持ちはあるのですが、今日は疲れてるのでアウトラインのみ。

1. 　網羅的な遺伝子発現解析の手法の一つにSAGEやMPSSがある。これは、cDNAの特徴的な短い配列（Tag） のみをライブラリ化してシーケンス解析して、シーケンス中に占めるTagの出現回数で遺伝子の発現程度を測定する手法だ。 この手法のランニングコストは、ほぼシーケンスのコストに従う。
2. マイクロアレイは発明からされてから今年で10年目。生物種を選ぶ発現解析プラットホームだ。 解析コストは初期よりは下がってきたものの、もっとスケールメリットが出ないとあまり普及しないだろう。
3. コンピューターの性能向上を言い表す「ムーアの法則」というものがある。コンピューターの性能は18ヶ月で2倍になる、 というものだ。この10年間に限って言えば、シーケンス決定のコストは5年ごとに1/10になっている。この傾向を外挿すると、 10年後にはSAGEやMPSSのコストは1回当たり1万円以下になる可能性がある（今、100万円としても、5年後には10万円、 10年後には1万円）。
4. マイクロアレイのコストは、この10年間に1/10には下がっていない。 （イネ44Kアレイは4反復で10万円以下であろうから、1/4-1/5くらいにはなっているか？）
5. 従って、SAGEやMPSSのコストはいずれは、マイクロアレイを下回る可能性がある。
6. SAGEやMPSSはゲノム情報が完備していない生物にもある程度適用できるので、マイクロアレイよりも潜在的な需要は大きい。

　ということで10年くらいのスパンで考えると、いずれマイクロアレイは消え行く宿命にある・・・のではないだろうか。だとしたら、アレイを使った大規模解析の「旬」はあと10年以内かもしれない。

blogランキングに登録しています。クリックしていただけると筆者が喜びます。”人気blogランキングへ”